1、塔里木河：突厥語(yǔ)，“（注入湖泊和沙漠的）河水支流”；維語(yǔ)，“脫韁的野馬”

2、伊犁河：準(zhǔn)噶爾蒙古語(yǔ)，“光明顯達(dá)”。

3、喀什河：伊犁河支流。維吾爾語(yǔ)，“眉毛”。

4、特克斯河：伊犁河支流。蒙古語(yǔ)，“野山羊眾多的河”。

5、鞏乃斯河：蒙古語(yǔ)，“踏地有聲”。

6、木扎爾特河：突厥語(yǔ)，“冰河山口”。

7、霍爾果斯河：中哈界河。蒙古語(yǔ)，“糞蛋”。

8、阿克蘇河：維吾爾語(yǔ)，“（水）流吧”或“白水河”。

9、蓋孜河：從帕米爾高原發(fā)源?？?tīng)柨俗握Z(yǔ)：“分水嶺”。

10、和田河：古代尉遲（部落）名。一說(shuō)為蒙古語(yǔ)，“玉的村邑”。匯入塔里木河。

11、玉龍喀什河：和田河支流。突厥語(yǔ)，“白玉河”。

12、喀拉喀什河：和田河支流。突厥語(yǔ)，“黑玉河”、“烏玉河”。

13、克里雅河：維吾爾語(yǔ)“來(lái)而未定”或“村落、村鎮(zhèn)”。流入塔克拉瑪干沙漠中。

14、安迪爾河，在民豐縣，維吾爾語(yǔ)，“河邊的河”。

15、瓦石峽河，在若羌縣，維吾爾語(yǔ)，“繁華”。

16、車爾臣河：古代漢語(yǔ)名，不詳。

17、喀拉米蘭河，在且末縣境內(nèi)，“喀拉”，維吾爾語(yǔ)，“黑色”；“米蘭”，蒙古語(yǔ)“米勒”，意思是：“駿馬奔馳的地方”。

18、葉爾羌河：突厥語(yǔ)，“朋友的村鎮(zhèn)”、“崖上的城市”。匯入塔里木河。

19、喀什噶爾河：突厥語(yǔ)，玉石集散地。匯入塔里木河。

20、克孜勒蘇河：突厥語(yǔ)，“紅色的水”。

21、托什干河：維吾爾語(yǔ)，“兔子河”。阿克蘇河的上游。

22、吐曼河，在喀什市內(nèi)，維吾爾語(yǔ)，“霧河”。

23、庫(kù)車河，古吐火羅語(yǔ)，現(xiàn)代維吾爾語(yǔ)為“白”、“明亮”。

24、開(kāi)都河：準(zhǔn)噶爾蒙古語(yǔ)，“曲折”。

25、孔雀河：維吾爾語(yǔ)稱為“昆其”，意為“皮匠”或“干涸的河”。

26、額爾齊斯河：中國(guó)惟一流入北冰洋的河流。突厥語(yǔ)，“河流湍急”。

27、青格里河：蒙古語(yǔ)，“娛樂(lè)”。

28、烏倫古河：蒙古語(yǔ)，“斑白的河灣”。

29、布爾津河：蒙古語(yǔ)，“放公駝的人”。匯入額爾齊斯河。

30、禾木河：布爾津河的支流，蒙古語(yǔ)，“駱駝肩背”。匯入布爾津河。

31、哈納斯河：“哈納斯”，蒙古語(yǔ)，“陡峭”。也有人說(shuō)是“圣水”，說(shuō)法不一。匯入布爾津河。

32、哈巴河，蒙古語(yǔ)，一種小魚(yú)，也叫“葫蘆片魚(yú)”。

33、塔斯提河：哈薩克語(yǔ)，“多石的河”

34、額敏河，蒙古語(yǔ)，“馬鞍形（的河）”。

35、和布克河，蒙古語(yǔ)，“梅花鹿”河。

36、博爾塔拉河：蒙古語(yǔ)，“灰色的草原”。

37、烏魯木齊河：蒙古語(yǔ)，優(yōu)美的牧場(chǎng)。

38、阿拉溝：蒙古語(yǔ)，為一（可治病的）藥材之名。水量大時(shí)進(jìn)入艾丁湖。

39、呼圖壁河：蒙古語(yǔ)，“吉祥”。流入沙漠。

40、瑪納斯河：蒙古語(yǔ)，“巡邏者”。流入瑪納斯湖。

41、奎屯河：蒙古語(yǔ)，“寒冷”。